Dlaczego czasem obie kopie genu pochodzą od jednego rodzica?

0

Na ogół dziedziczymy po jednej kopii każdego genu od każdego rodzica. Zdarza się jednak, że mechanizmy podziału komórek „pomyłkowo” sprawiają, iż obie kopie genu – a czasem nawet cały chromosom – pochodzą tylko od jednego rodzica. To niezwykłe zjawisko, znane jest jako disomia jednorodzicielska.

Słowniczek pojęć:

Disomia jednorodzicielska (UPD, ang. uniparental disomy) – zjawisko genetyczne, w którym obie kopie chromosomu (lub jego fragmentu) pochodzą od jednego, tego samego rodzica. Występowanie UPD może być bezobjawowe, ale w określonych przypadkach prowadzi do ujawnienia chorób autosomalnych recesywnych oraz zaburzeń związanych z imprintingiem genomowym.

Choroba dziedziczona autosomalnie recesywnie – choroba genetyczna, która ujawnia się tylko wtedy, gdy dana osoba odziedziczy dwie kopie zmutowanego genu (po jednej od matki i ojca). Osoba posiadająca tylko jedną kopię mutacji jest nosicielem i zazwyczaj nie wykazuje objawów choroby.

Nosiciel – osoba, która ma jedną prawidłową kopię genu i jedną nieprawidłową. Zazwyczaj nie wykazuje objawów choroby, ale może przekazać mutację swojemu potomstwu.

Imprinting genomowy (piętnowanie genomowe) – zjawisko epigenetyczne polegające na tym, że ekspresja genu zależy od jego pochodzenia rodzicielskiego. Oznacza to, że pewne geny są aktywne tylko wtedy, gdy zostały odziedziczone od matki, a inne – tylko od ojca. Druga kopia (od drugiego rodzica) jest „wyciszona” w wyniku modyfikacji epigenetycznych, np. metylacji DNA. W ludzkim genomie istnieje ok. 150 genów, które ulegają piętnowaniu genomowemu.

Ekspresja genu – proces, w którym informacja zapisana w genie (w DNA) jest wykorzystywana do wytworzenia produktu, np. białka lub cząsteczki RNA. To właśnie ekspresja genów decyduje o funkcjonowaniu komórek i cechach organizmu.

Metylacja DNA – jedna z modyfikacji epigenetycznych, polegająca na dołączaniu grup metylowych (–CH₃) do cząsteczki DNA. Zwykle prowadzi to do „wyciszenia” genu, czyli obniżenia lub zahamowania jego ekspresji, bez zmiany samej sekwencji DNA.

Wprowadzenie

Zjawisko disomii jednorodzicielskiej zostało po raz pierwszy opisane przez Spence i współpracowników (1988), którzy wykazali, że mutacja recesywna może ujawnić się u dziecka, mimo że tylko jeden z rodziców jest nosicielem. Pierwszy opis zjawiska disomii jednorodzicielskiej pochodzi z pracy Spence i wsp. z 1988 roku. W publikacji opisano przypadek, w którym dziecko miało mukowiscydozę (chorobę autosomalnie recesywną), mimo że tylko matka była nosicielką mutacji w genie CFTR. Analiza wykazała, że dziecko odziedziczyło obie kopie chromosomu 7 od matki, co spowodowało homozygotyczność dla mutacji i ujawnienie choroby – właśnie to było pierwszym dowodem na istnienie UPD u człowieka [1]. Od tego czasu wykazano, że UPD odgrywa istotną rolę w etiologii zarówno rzadkich chorób genetycznych, jak i zaburzeń imprintingowych. 

obraz 1

Ryc.1. Schemat przedstawiający mechanizm powstawania UPD [2].

Po co UPD w biologii?

Zgodnie z aktualnym stanem wiedzy, rodzicielskie piętno genomowe stanowi prawdopodobnie mechanizm zapobiegający partenogenezie u ssaków. Badania wykazują, że rozwój zarodków parthenogenetycznych (z jednym rodzajem materiału genetycznego) jest zaburzony z powodu braku odpowiedniej ekspresji genów zależnej od ich pochodzenia rodzicielskiego. Dowodem na tę hipotezę są badania, w których stworzono myszy z dwoma ojcami (bipaternalne). Pomimo że takie zarodki przeżyły do dorosłości, wykazywały poważne nieprawidłowości rozwojowe, skróconą długość życia i bezpłodność. Ustalono, że przyczyną tych problemów było zaburzenie imprintingu genomowego, który jest kluczowy dla prawidłowego rozwoju zarodka [3]. Inne badania wskazują, że zarodki parthenogenetyczne myszy, mimo prawidłowej ilości materiału genetycznego, nie rozwijają się prawidłowo z powodu braku odpowiedniej ekspresji genów zależnej od ich pochodzenia rodzicielskiego. Wynika to z faktu, że imprinting genomowy powoduje, iż geny rodzicielskie nie są równoważne, co uniemożliwia rozwój zarodka partenogenetycznego [4].

Ciekawostka: Jednym z przykładów działania imprintingu genomowego jest krzyżowanie konia i osła. Jeśli skrzyżowana zostanie samica osła z ogierem konia, powstaje osłomuł, natomiast w przypadku skrzyżowania samicy konia z samcem osła, powstaje muł. Muł charakteryzuje się fenotypem łączącym masywność i siłę konia z wytrzymałością oraz odpornością osła, natomiast osłomuł ma mniejszy rozmiar ciała i jest słabszy od muła. W efekcie pochodzenie matczyne i ojcowskie materiału genetycznego wpływa na rozwój i cechy potomstwa, co powoduje odmienne fenotypy muła i osłomuła.

Typy UPD:

  • Heterodisomia – dziecko otrzymuje dwie różne kopie chromosomu od jednego rodzica. Heterodisomia powstaje w wyniku nondysjunkcji chromosomów homologicznych podczas pierwszego podziału mejotycznego w procesie gametogenezy.
  • Izodisomia uniparentalna (UPID, ang. uniparental isodisomy) – w komórce obecne są dwie identyczne kopie tego samego chromosomu, również pochodzące od jednego rodzica. Izodisomia jest skutkiem nondysjunkcji chromatyd siostrzanych podczas drugiego podziału mejotycznego.

UPD w patogenezie chorób człowieka

W wyniku UPD może dojść do zaburzenia imprintingu genomowego lub ujawnienia recesywnych mutacji. Wybrane choroby związane z imprintingiem i UPD przedstawiono w poniższej tabeli.

Przykłady chorób związanych z imprintingiem i UPD:

ChromosomTyp UPDZespół/chorobaGłówne objawy kliniczne
15Matczyna UPDZespół Pradera-WilliegoHipotonia, hiperfagia, otyłość, upośledzenie
15Ojcowska UPDZespół AngelmanaAtaksja, drgawki, deficyt mowy, upośledzenie
7Matczyna UPDZespół Silvera-RussellaNiskorosłość, asymetria ciała, opóźnienie wzrostu
14Ojcowska UPDZespół Kagami-OgataDysmorfia, deformacje klatki piersiowej, hipotonia
14Matczyna UPDZespół Temple’aHipotonia, opóźniony rozwój, przedwczesne dojrzewanie
11Ojcowska UPDZespół Beckwitha-WiedemannaMakrosomia, organomegalia, ryzyko guzów

Najczęściej wymienianymi i znanymi zespołanu związanymi z UPD jest zespół Pradera-Williego (PWS, ang. Prader-Willi syndrome) oraz zespół Angelmana (AS, ang. Angelman syndrome). Obydwa zespoły są związane z tym samym regionem (q11-q13) na chromosomie 15.

Ryc.2. Schemat przedstawiający UPD w zespołach PWS oraz AS.

Ciekawostka: W badaniach nad Zespołem Angelmana, historyczne dzieła sztuki mogą dostarczać nieoczekiwanych informacji o fenotypie pacjentów sprzed wielu stuleci. Przykładem jest wpływ obrazów renesansowych i barokowych, które zainspirowały współczesnych badaczy do opisania charakterystycznych cech tej choroby. 

obraz3

Harry Angelman, opisując w 1965 r. swoich pacjentów, nawiązał do obrazu Giovanniego Francesca Caroto przedstawiającego dziecko o radosnym, nieco „marionetkowym” wyglądzie; podobieństwo to stało się inspiracją dla określenia choroby mianem „Happy Puppet Syndrome” (dziś uznawanego za przestarzałe i stygmatyzujące), obecnie znanego jako Zespół Angelmana.

Portret Doñy Eugenii Martínez Vallejo autorstwa Juana Carreño de Mirandy (ok. 1680) przedstawia około sześcioletnią dziewczynkę, której fenotyp – m.in. otyłość, niskorosłość i dysmorfia twarzy – jest zgodny z cechami obserwowanymi u osób z zespołem Pradera-Williego (PWS). Obraz ten stanowi jeden z najwcześniejszych znanych przykładów historycznego przedstawienia osoby z charakterystycznymi cechami PWS.

Poniżej zestawiono najważniejsze różnice i podobieństwa między PWS a AS, obejmując mechanizmy genetyczne, rozwój fizyczny i neurologiczny, cechy zachowania oraz charakterystyczne cechy twarzy i ciała.

Cecha / ZespółPradera-Williego (PWS)Angelmana (AS)
Chromosom / region15q11-q1315q11-q13
Geny nieaktywneGeny ojcowskieGen UBE3A matczynego pochodzenia
Mechanizm UPDUPD matczyna (oba chromosomy od matki)UPD ojcowska (oba chromosomy od ojca)
Delecja chromosomuDelecja ojcowska (~70% przypadków)Delecja matczyna (~70% przypadków)
Błędy imprintingu / mutacjeRzadko, mutacje genów regulujących imprintingMutacje genu UBE3A lub błędy imprintingu
Rozwój fizyczny i neurologicznyHipotonia u noworodków, opóźnienie rozwojuOpóźnienie rozwoju, ataksja
Zachowanie i charakterNadmierny apetyt, otyłość, zaburzenia hormonalneRadosny wygląd, częsty śmiech, drgawki
Cechy twarzy / fizyczneWąska czoło, wąskie ustaMikrocefalia
Dodatkowe objawyHipogonadyzm, zaburzenia mowy i motorykiZaburzenia snu

Diagnostyka UPD

Metody diagnostyczne UPD obejmują przede wszystkim cytogenetykę molekularną i analizę sekwencji. W cytogenetyce mikrosatelity (STR) pozwalają porównać allele dziecka i rodziców, wykrywając zarówno izo-, jak i heterodisomię. SNP-array (CMA) identyfikuje obszary homozygotyczne (LOH), szczególnie przydatne przy izodisomii, a MLPA ocenia imprinting oraz delecje lub duplikacje genów. Analiza sekwencji za pomocą NGS (panel lub eksom) wraz z genotypowaniem rodziców umożliwia wykrycie UPD oraz ujawnienie recesywnych wariantów genetycznych. Wymienione badania wykonuje i analizuje wykwalifikowany personel medycznego laboratorium genetycznego.

Podsumowanie

Disomia jednorodzicielska jest zjawiskiem o złożonych konsekwencjach biologicznych, zależnych od typu UPD oraz chromosomu, którego dotyczy. Może prowadzić zarówno do ciężkich zespołów imprintingowych, jak i ujawnienia chorób recesywnych. Postęp w metodach diagnostyki genomowej sprawia, że UPD coraz częściej rozpoznawana jest w praktyce klinicznej. Jej uwzględnienie w diagnostyce jest kluczowe w przypadku fenotypów sugerujących choroby imprintingowe lub niespodziewane ujawnienie mutacji recesywnych.

Źródła:

  1. Spence JE, et al. Uniparental disomy as a mechanism for human genetic disease. Am J Hum Genet. 1988;42(2):217–226.
  2. https://www.researchgate.net/publication/236209646_T_Liehr_What_is_uniparental_disomy_UPD_online_Oxford_Gene_Technology_Available_at_httpwwwogtcoukcytosure_whatisUPDhtml
  3. https://www.reuters.com/science/scientists-use-genetic-engineering-create-mice-with-two-male-parents-2025-01-28/
  4. https://www.nature.com/articles/s41598-018-27863-7

Autor: mgr Sylwia Purwin

5/5 - (5 votes)
Subscribe
Powiadom o
guest
0 komentarzy
najstarszy
najnowszy oceniany
Inline Feedbacks
View all comments
0
Masz przemyślenia? Napisz komentarz!x